怀孕36天流出褐色分泌物，可能涉及以下几种情况：

首先，这可能是着床出血的一种表现。在受精卵着床过程中，有时会导致轻微的子宫内膜剥落，从而引发少量出血，经过阴道流出时可能呈现褐色。这种情况通常是正常的生理现象，不会对母婴健康产生影响。

其次，褐色分泌物也可能是激素水平波动的反映。怀孕初期，由于激素水平的大幅变化，可能导致子宫内膜的一些小血管破裂，出现轻微出血。

再者，需要警惕的是，褐色分泌物有时也可能是先兆流产的征兆。如果伴随腹痛或其他不适感，应及时就医检查，以确保母婴安全。

另外，妇科炎症或感染也可能导致褐色分泌物的出现。这种情况下，除了分泌物异常外，还可能伴有异味、瘙痒等症状，需要及时就医进行诊断和治疗。

最后，还要考虑到异位妊娠等较为罕见但严重的情况。异位妊娠可能导致不正常出血，对母体健康构成威胁。

总之，怀孕初期流出褐色分泌物可能涉及多种原因，既有生理性的也有病理性的。孕妇在遇到这种情况时，应保持冷静，及时就医，遵医嘱进行科学处理。切勿自行用药或忽视症状，以保障母婴健康。